为进一步提高全省城镇化的质量和水平，改善城乡发展面貌，建设山水田园一幅画、城镇村落一体化的美丽云南，省财政厅积极转变理念、创新工作思路，多渠道筹措省级补助资金，全面推进云南省“一水两污”项目建设。
为加强全省城镇和建制镇供水、污水和生活垃圾处理设施项目建设，省财政厅通过一般预算收入、地方政府债券等渠道筹措省级补助资金，2013年至2015年，每年筹措落实资金5亿元，已累计安排资金15亿元，2016年至2017年，还将继续筹措安排资金10亿元。结合云南省“一水两污”项目建设资金筹集困难的实际，打破以往“仅依靠政府投资，单项目运作”的模式，在红河州弥勒市、建水县、石屏县试行“城乡打包、连片开发、捆绑运作”模式，即将一个县域内运营条件较好的城市“一水两污”项目与难以吸引社会投资的乡镇“一水两污”项目，一并打包设计、包装、整体建设运营。目前，弥勒市和建水县“一水两污”项目已经列入财政部第二批PPP示范项目，并正在有序推进。
在项目体系规划编制上，安排专项经费，积极支持住建部门明确各县(市、区)的镇(乡)“一水两污”设施建设目标和计划，将规划落到实处。截至目前，全省129个县(市、区)已全部编制完成《县域镇(乡)“一水两污”设施建设体系规划》，并通过由省村镇规划建设管理专家委员会组织的省级技术审查。针对建制镇“一水两污”项目推进慢的问题，联合住建部门改进项目前期工作，简化审批工作流程，单个项目的前期设计费用由原来的约100万元降低到20—30万元，审批时间由原来的8—10个月缩减到3个月以内，并通过定期和不定期检查、重点督查、专项核查、定期通报、信息系统填报等多种方式，加大督查指导力度，在确保项目进度基础上，严格进行资金管理，确保项目资金安全运行。